基础医学研究所是隶属于基础医学部的科研机构，面向全校和校外开放，承担基础医学部和学校各项国家级和省部级科研课题的实施。研究所现有服务工作人员10人，其中教授2人，实验员8人，为实验室的正常运转提供服务与保障，为广大科研人员服务。研究所总占地面积1500平方米，仪器设备266台，仪器设备总值1800万元，设备先进，功能齐全。主要仪器设备包括激光共聚焦显微镜、流式细胞仪、蛋白分离纯化与冻干系统、图像采集和分析系统、核酸和蛋白分离纯化分析系统、膜片钳系统、脑片灌流系统、动物行为学监测系统、动物整体代谢分析系统以及细胞培养和动物饲养等设备，可完成细胞生物学、分子生物学、组织形态学、整体动物学、微生物学等多个方面的实验研究，满足生命科学和医药研究的基本需要。目前承担着三十余项国家和省部级科研课题的实验研究工作，为广大教职工的科研工作提供有力的支撑。